Почему при сохранении увеличивается размер файла?
По умолчанию при сохранении файла Infix сохраняет в него и свой макет разметки PDF - табы, абзацы, и т.д. (подробнее см. manual.pdf, страница 226, раздел Store layout info in PDF). Это легко увидеть, посмотрев в свойствах документа (Ctrl+D) значение Схема Infix: Да | Нет.
Если сохранение в документе макета Infix Вам не нужно, то в настройке Файл - Параметры - Сохранение - Сохранять данные макета в PDF (по умолчанию Всегда) поставьте Никогда или Иногда.